Magnetski senzor radi na način, da na vratima ili prozoru stvori magnetsko polje. To se prekida u slučaju neovlaštenog otvaranja, pa se aktivira alarm. Senzor šalje signal za alarm središnjoj jedinici, čim se komponente senzora razdvoje za više od 15–30 mm. Prikladan je za montažu na većinu prozora i vrata (slabiji rezultati mogu se postići sa željeznim vratima). Prednost magnetnih senzora je vrlo malo lažnih alarma, jer se možemo u prostoru **lako kretati. U slučaju ispražnjenih baterija, senzor šalje upozorenje glavnoj jedinici.

Napomena: Sa željeznim vratima rezultati senzora mogu biti slabiji.

Magnetski senzor se koristi u prostorijama u kojima se PIR senzor ne može koristiti zbog kretanja i vrućine i gdje želimo imati zaštitu u 24/7 modu (npr. požarni izlazi, krovni otvori, vrata kotlovnice. Magnetski senzor nije zamjena za pasivni IR senzor. Pasivni IR senzor (PIR) je i dalje najpreporučljivija i najjednostavnija zaštita prostora! Provalnik može zaobići magnetski senzor na prozorima jednostavnim razbijanjem stakla i time ne prekidajući magnetsko polje. Prostor ostaje nesmetan, jedino PIR senzor štiti volumen prostorije.